公司经营三项本地铁路客运服务。东铁提供尖沙咀至罗湖边界以及马鞍山至大围的集体运输服务。西铁是于二零零三年十二月启用的集体运输系统，提供新界西北至九龙市区的铁路服务。轻铁原是地区性的运输系统，现已成为接驳西铁的主要交通工具。以上铁路网络皆设有接驳巴士服务。东铁本身有列车行走九龙与广州之间，并与内地铁路机构合办来往广州、上海及北京等内地城市的城际客运服务。东铁也经营货运业务，主要往返香港与内陆地区。此外，公司亦在铁路沿线与合营伙伴合作发展物业。

　　为满足香港市民的未来运输需求，九广铁路公司现正兴建或筹划兴建多条新铁路，包括落马洲支线、九龙南线，以及沙田至中环线。此外尚有两个项目在研究阶段：北环线及区域快线。